黄芩为唇形科植物黄芩的干燥根，为中药中著名“三黄”之一。古代黄芩分枯芩与子芩。枯芩（宿芩）为生长年久的宿根，中空而枯，体轻主浮，善清上焦肺火，主治肺热咳嗽痰黄；子芩（条芩）为生长年少的子根，体实而坚，质重主降，善泻大肠湿热，主治湿热泻痢腹痛。而今多不再区分。作为传统的清热药，黄芩可用于治疗高热烦渴、身热咳嗽、泻痢、黄疸、头痛、腹痛、淋浊、目赤肿痛、吐血、衄血、子宫出血、胎动不安、痈肿疔疮等病症。
黄芩首载于《神农本草经》中品，曰：“黄芩，味苦平，主诸热，黄疸，肠澼，泄痢，逐水，下血闭，恶疮疽蚀，火疡。”黄芩在经方中使用率较高，共有26方有黄芩，主要取其清热解毒、凉血安胎之功。下面仅就黄芩治疗脏腑热证之功，讨论如下。
麻黄升麻汤：麻黄、升麻、当归、知母、黄芩、萎蕤（一作菖蒲）、芍药、天门冬（去心）、桂枝（去皮）、茯苓、甘草（炙）、石膏（碎，绵裹）、白术、干姜。适用于肺中郁热及脾虚下利的上热下寒证，配伍使用黄芩的目的就是配合石膏、知母等，清泻肺之郁热。因为是郁热，故又与麻黄、升麻发越郁阳之药相伍，正和“火郁则发之”之意。《滇南本草》的“上行泻肺火”之说，就源于如此。
泽漆汤：半夏、紫参（一作紫菀）、泽漆（以东流水2升，煮取800毫升）、生姜、白前、甘草、黄芩、人参、桂枝。适用于肺中停饮，郁而化热之咳喘证。配伍黄芩的目的仍是清泻肺热（此热为饮郁之热）。治病必求其本，故方重在消痰逐水，诸药相配共奏清热逐水，通阳化饮之功。
心火亢盛证
泻心汤：大黄、黄连、黄芩。治疗邪热壅滞心下，气机痞塞证。适用于邪火内炽，迫血妄行，吐血，衄血，便秘溲赤，舌苔黄腻，脉数实者。
黄连阿胶汤：黄连、黄芩、芍药、阿胶、鸡子黄。主治心火过亢，肾阴亏乏而致“心中烦，不得卧”之证。方中黄芩配黄连清心火而坚阴，因为肾中真阴亏乏，故又用阿胶、芍药、鸡子黄添补真阴。这是清心滋阴，交通心肾的开山之方。
胃热证
附子泻心汤：大黄、黄连、黄芩、附子。主治阳虚于外，热结于胃。心下痞满，而复恶寒汗出，脉沉者。
干姜黄芩黄连人参汤：干姜黄芩黄连人参。主要用胃热脾寒上吐下利之证。
半夏泻心汤：半夏、黄芩、干姜、人参、炙甘草、黄连、大枣。此方也用于胃热脾寒，上吐下利之证。方中黄芩协助黄连清胃热，干姜与人参温中健脾，此为寒热分居上下，故称上热下寒证。
生姜泻心汤：生姜、黄芩、人参、干姜，半夏、黄连、大枣。
甘草泻心汤：甘草、黄芩、干姜、半夏、大枣、黄连。此二方在治疗胃热方面与半夏泻心汤的机理差不多，故不再赘述。
肝郁热证
侯氏黑散：菊花、白术、细辛、茯苓、牡蛎、桔梗、防风、人参、矾石、黄芩、当归、干姜、川芎、桂枝。治疗肝旺脾虚湿痰素盛，外风引动内风之证。
当归散：当归、黄芩、芍药、川芎、白术。该方用于湿热胎动不安证。这边是黄芩为安胎圣药的由来。
奔豚汤：甘草、川芎、当归、半夏、黄芩、生葛、芍药、生姜、甘李根白皮。该方治疗肝热奔豚证。奔豚证的病机是肝郁化热，充气上冲。黄芩配伍葛根，协助李根白皮清热平肝。黄芩配伍当归、白芍养血清肝。
胆热证
小柴胡汤：柴胡、黄芩、人参、半夏（清）、甘草（炙）、生姜（切）、大枣，治疗胆火肆逆，枢机不利证的少阳热证。方中黄芩与柴胡是相须配伍。《本草汇言》曰：“清肌退热，柴胡最佳，然无黄芩不能凉肌达表”。可见黄芩是清解少阳之热不可缺少之品。
黄芩汤：黄芩、甘草（炙）、芍药、大枣，治疗胆热下利证，该证的病机是少阳胆热內迫阳明，下趋大肠而致的下利。黄芩，《神农本草经本经》曰：主“肠澼，泄痢”。黄芩配芍药并能入血分，清除血中之热，故后世用本方专治湿热下利脓血的痢疾，为治疗痢疾的祖方。
大肠湿热证
葛根黄芩黄连汤：葛根、甘草、黄芩、黄连。
方中黄芩配黄连，清热坚阴止利，黄芩并能与葛根配合，加强葛根解肌退热之功。
